研究院组织开展分子动力学模拟培训
作者:院办公室 时间:2026-06-11 点击数:
2026年6月8日和10日,我院于科技园阳光楼南913-1会议室顺利开展了分子动力学模拟培训。本次培训由2024级研究生徐嘉铭同学担任主讲,研究院师生参加培训。
培训围绕分子动力学原理、力场分配与模拟设置、数据后处理三大模块展开系统讲解。徐嘉铭首先介绍了分子动力学的基本原理,阐述了初始位置、速度、受力与力场之间的内在关系,并分析了常见力场的适用场景。随后,结合扣电循环模拟的实际需求,详细讲解了能量最小化(EM)、等温等压弛豫(NPT)和等温等容采样(MD)三个阶段的作用,现场演示了拓扑文件的生成方法以及GROMACS工步的编写与运行流程。最后,他还展示了径向分布函数(RDF)的计算方法,并指导了VMD软件的可视化操作。



本次培训内容系统实用,帮助参训师生快速掌握了从建模到后处理的核心技能,为后续深入开展分子动力学相关研究奠定了坚实基础。